天昊基因建立并完善了包括Illumina GAIIx、Illuminate Miseq、Next Seq 500在內的二代測序平臺，利用先進的二代測序技術開展了全基因組測序、外顯子組測序、RNA測序、micro-RNA測序、LncRNA測序、甲基化測序等成熟的科研分析服務。此外，天昊基因在進行高質量技術服務的同時還積極集中優勢力量自主創新，利用二代測序技術不斷開發大量新的基因分析技術，例如目的區域富集技術FastTarget、高通量目標基因片段快速富集技術Easy Target?等：
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