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      基于毛細管電泳的中國漢族人群苯丙氨酸羥化酶基因的熱點突變檢測方法

      發稿時間:2021-11-11來源:

      高苯丙氨酸血癥患兒癥狀

             近日,由南京婦幼保健院發表的名為A capillary electrophoresis-based variant hotspot genotyping method for rapid and reliable analysis of the phenylalanine hydroxylase gene in the Chinese Han population (基于毛細管電泳技術的中國漢族人群苯丙氨酸羥化酶基因的變異熱點分型方法)一文中[1],就是采用的SNaPshot的方法來進行PAH基因檢測的。該研究同時采用二代測序和具備檢測96個HPA熱點突變的SNaPshot方法分析18例中國HPA患者,研究中NGS共成功鑒定出了36個PAH基因突變,而SNaPshot則在這群患者中鑒定出了33個突變。SNaPshot在3個患者中只發現了一個突變位點。之后,采用Sanger測序對PAH基因的13個外顯子進行了直接測序,發現了這3個患者的另一個雜合突變。漏檢的這3個突變,在SNaPshot這個PAH的檢測體系中沒有包括。其中c.734T>C, c.1220C>T這兩個位點以前在中國人群中沒有報道過。因此,SNaPshot的這個體系,對突變的檢出率為(33/36) 91.6%。

             隨后該研究使用SNaPshot的這個檢測體系對中國東部地區的4276人進行HPA突變譜系的檢測,共檢出了27個不同的突變類型。在這些人群中PAH基因突變的攜帶率約為1/58 (1.73%),其中c.728G > A是最常見的突變。

             該研究中采用的PAH 96個熱點突變的SNaPshot檢測體系,是由南京婦幼保健院與我司天昊生物醫藥科技(蘇州)有限公司共同開發,通過該研究中大規模人群的應用,證實該檢測體系選取的熱點突變具有人群覆蓋度高的特點(目前PAH在數據庫中報道的中國人群中的熱點突變,該體系幾乎都覆蓋)。在本次研究中,漏檢的2個位點是在中國人群中首次報道的突變,這類數據庫中沒有收錄的突變即使采用NGS的方法也無法檢出。所以,SNaPshot的篩查效率幾乎可與NGS相媲美,但檢測速度更快(僅需3天),價格更低。因此,無論是臨床上疑似PAH的病人初篩還是大規模普通人群的普篩,都不失為一種有效的篩查手段。

             目前,PAH的基因檢測國內還沒有有證的試劑盒,而我司不僅有單項的PAH檢測體系,更有攜帶者篩查的組合體系(15種國人高發遺傳病攜帶者篩查),可滿足臨床不同的需求。PAH由于地域性的差異,國內各地區的發病率并不相同。我國的PAH總體發病率約為1/11614 [2],但北方高于南方。如甘肅發病率為1/3420,甘肅省的7個市(州)蘭州市、白銀市、武威市、酒泉市、定西市、臨夏州和甘南州的發病率為1/2268~1/4415之間,與同屬西北地區的寧夏[3](寧夏PAH的發病率約為1/3030)、新疆[4](新疆地區發病率約為1/2366)發病率相近,內蒙古(發病率為1/1942)的發病率更高。遼寧省[5](發病率1/6403),黑龍江[6](發病率1/7841)的發病率也明顯高于我國南方的一些地區,如廣州[7](發病率為1/30606),福建[8](發病率為1/32850),湖南[9](發病率為1/33694)。符合我國PKU發病率北方人群高于南方人群的特點。因此,在全國,尤其是我國北部地區開展PAH的普通人群篩查尤為重要。這是減少PAH患兒出生,提高出生人口質量的有效方法。




      參考文獻:

      [1]. Binbin. Shao, An Liu, Jingjing Zhang et al., A capillary electrophoresis-based variant hotspot genotyping method for rapid and reliable analysis of the phenylalanine hydroxylase gene in the Chinese Han population. Clinca Chimica Acta

      [2]. 國娟、劉奇杰、王書平,等. 寧夏2007-2010 年新生兒先天性甲狀腺功能減低癥和苯丙酮尿癥篩查情況分析[J].中國新生兒科雜志,2011,32(9):409-410

      [3]. 李之光、薛淑媛,馬光娟,等. 新疆地區40216例新生兒苯丙酮尿癥篩查結果分析[J]. 中國優生與遺傳雜志,2011,19(5):84-85

      [4]. 李小洪、鄧奎、王艷萍,等. 中國大陸地區苯丙酮尿癥發生率的空間聚集性分析[J].中國優生與遺傳雜志, 2014年第9期

      [5]. 穆雪、霍晶、馬海玲,等. 新生兒苯丙酮尿癥篩查十年結果分析[J]. 中國臨床醫師雜志,2011年,第5卷第6期

      [6]. 李蓓、江劍輝、曹偉鋒,等. 廣州市1071203例新生兒苯丙酮尿癥篩查結果回顧性分析[J]. 中國婦幼保健,2011,26(6)

      [7]. 朱文斌、王振南、陳涵強,等. 福建省新生兒苯丙酮尿癥篩查狀況分析[J]. 海霞預防醫學雜志,2020年第4期

      [8].鄢慧明、唐華、胡浩,等.2001~2011年湖南省新生兒苯丙酮尿癥(PKU)篩查結果分析與體會. 第五屆全國新生兒疾病篩查技術與管理新進展學術研討會

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