<rp id="y8oyv"></rp>
      <tbody id="y8oyv"></tbody>

    1. <tbody id="y8oyv"></tbody>
    2. <dd id="y8oyv"><center id="y8oyv"></center></dd>


      • 免費服務熱線
      • 400-065-6886
      • 電話:86(0)512-6295 9990
      • 傳真:86(0)512-6295 9995
      新聞中心

      Cancer Cell-單細胞分析非小細胞肺癌細化腫瘤分類和患者分層

      發稿時間:2021-11-24來源:天昊生物

      1111日,西奈山伊坎醫學院研究團隊在Cancer Cell雜志在線發表了題為“Single-cell analysis of human non-small cell lung cancer lesions refines tumor classification and patient stratification”的文章。利用單細胞RNA測序(scRNA-seq)在多個NSCLC損傷中發現了一種肺癌激活模塊(lung cancer activation module,LCAMhi)由PDCD1+CXCL13+激活的T細胞, IgG+漿細胞及SPP1+巨噬細胞組成,并且證實了一些NSCLC隊列中均存在LCAMhi,利用細胞表面蛋白測序(CITE-seq)能夠鑒定LCAMhi損傷。LCAM的存在與整體免疫細胞含量無關,與TMB、癌睪丸抗原和TP53突變相關。即使在中位TMB以上的患者中,LCAM基線評分較高也與增強的NSCLC對免疫治療的應答相關,這表明免疫細胞組成雖然與TMB相關,但可能是免疫治療應答的非冗余生物標志物。

      在這項研究中作者整合了35NSCLC患者損傷部位的scRNA-seq數據、8例患者配對腫瘤和正常肺的CITE-seq數據以及與3例患者的TCR-seq數據(如下圖),并建立了一個交互式網站共享這些數據(https://scdissector.org/leader)。

      對瘤內的樹突細胞(DC)分析發現最近一些研究中注釋的DC3是最主要的樹突細胞亞群,腫瘤中的DC表現出一種LCH(朗格漢斯細胞組織細胞增生癥)樣模塊,以CD1A,CD207IL22RA2高表達為特征。


      巨噬細胞分析發現腫瘤中顯著富集的是單核來源的巨噬細胞(MoMΦ),而正常肺中顯著富集肺泡巨噬細胞(AMΦ),這些巨噬細胞亞群之間基因表達模塊各不相同。

      利用配對的scRNA-seqTCR-seq數據發現以PD-1,ICOSCD39蛋白增加為特征的激活的T細胞(Tactivated)在腫瘤中克隆最多。通過正常肺、腫瘤或兩者間的克隆擴張來區分TCR,證實了在這些分類中顯示出不同的表型富集。腫瘤中的Tactivated積累至少部分因為局部分克隆擴張。

      B細胞和漿細胞在腫瘤免疫細胞中是增加最多的譜系,但是B細胞與漿細胞的比例整體上不變。

      為了確定可能驅動患者多樣性的細胞表型之間的聯系,作者將不同腫瘤的譜系歸一化細胞類型頻率進行了關聯,揭示了Tactivated、IgG+漿細胞和MoMΦ-II之間的高度相關性,因此,統稱這一組為肺癌激活模塊(LCAMhi)。作者證實了LCAM分類的可重復性,并且利用免疫組化和細胞通訊驗證了LCAM的可靠性。進一步分析發現LCAM與腫瘤突變負荷、異位抗原和驅動突變等相關。